根據《台灣府誌》記載，仁壽宮創建於明鄭時期。宮內主祀之保生大帝神尊為三百餘年前，明定國公鄭鴻逵之部將吳鳩山，隨鄭成功來台時，為祈求海途順遂，向福建省同安縣白礁祖廟虔心跪求，隨行奉祀，抵台之初供奉於吳宅。因大帝神威顯赫，地方信眾廣獲庇佑，乃有立廟之議，經信眾鴆資創立廟堂，並於清雍正二年（西元1724年）增建兩廂，規模始具。

　　仁壽宮位於台南市歸仁區，轄境內祭祀圈分成五角頭，涵蓋八里，共十三座角頭廟宇，戶民數萬，是歸仁地區信仰中心，與地方開拓發展息息相關。